단일 세포 유전체학(single-cell genomics)은 생명 현상을 그 기본 단위인 세포와 유전자 수준에서 파악하려는 시도이다. 물질의 기본 단위인 원자의 발견이 물리화학에 혁신적 발전을 가져왔듯이, 우리 몸을 구성하는 모든 세포에 대한 유전체 지도를 제작하면 정상 세포의 변화와 질병에 이르는 과정을 한눈에 파악함으로써 '생명의 주기율표'를 찾아낼 수 있다. 본 연구실은 단일 세포 수준의 유전체 및 공간적 전사체 기법(spatial transcriptomics) 들을 활용하여 우리 몸의 세포 지도를 만드는 것을 목표로 한다.
세포 지도를 완성하기 위한 초석으로 집중하고 있는 두 가지 주제는 발생과 면역이다. '우리 몸이 만들어지는 원리'를 이해함으로써 세포를 우리가 원하는 방향으로 변화시키는 방법을 개발하고, '우리 몸을 지키는 원리'를 연구함으로써 다양한 질병의 해결책을 제시하고자 한다. 이를 위해서 세포 생물학(cell biology), 합성 생물학 (synthetic biology), 조직 공학(tissue engineering), 생명 정보학(bioinformatics), 데이터 사이언스, 임상 의학 등 다양한 학제의 방법론을 협업과 도전을 통해 융합해 나갈 것이다.

• Park, J.-E.*, Botting, R.A., Domínguez-Conde, C., Popescu, D.-M., Lavaert, M., Kunz, D.J., Goh, I., Stephenson, E., Ragazzini, R., Tuck, E., Wilbrey-Clark, A., Roberts, K., Kedlian, V.R., Ferdinand, J.R., He, X., Webb, S., Maunder, D., Vandamme, N., Mahbubani, K., Polanski, K., Mamanova, L., Bolt, L., Crossland, D., de Rita, F., Fuller, A., Filby, A., Reynolds, G., Dixon, D., Saeb-Parsy, K., Lisgo, S., Henderson, D., Vento-Tormo, R., Bayraktar, O.A., Barker, R.A., Meyer, K.B., Saeys, Y., Bonfanti, P., Behjati, S., Clatworthy, M.R., Taghon, T., Haniffa, M., Teichmann, S.A., 2020, A cell atlas of human thymic development defines T cell repertoire formation. Science (2019)

  367, eaay3224

  down
• Park, J.-E.*, Jardine, L.*, Gottgens, B., Teichmann, S.A., Haniffa, M.. Prenatal development of human immunity. Science (2020)

  368, 600–603.

  down
• Polański, K.*, Young, M.D.*, Miao, Z., Meyer, K.B., Teichmann, S.A. and Park, J.-E. BBKNN: Fast Batch Alignment of Single Cell Transcriptomes. Bioinformatics (2019)

  36, 964-965

  down